9月25日，省农业厅印发了《第二次全国污染源普查广东省农业污染源普查质量控制实施方案》。本次农业污染源普查是全国污染源普查的重要内容之一，包括种植业、畜禽养殖业、地膜、秸秆等调查、监测，涉及大数据分析及时空尺度的产排污量测算。《方案》根据全流程、全要素、全方位、可追溯的基本原则，建立起普查质量责任体系和质量控制管理岗位责任制，制定了普查工作人员要求、基础数据收集、入户前准备工作、入户调查工作要求，并对调查表审核和上报、原位监测控制、普查质量核查、普查验收、进度安排等作出了部署。

9月30日，省农业厅还成立了第二次全国污染源普查广东省农业源普查专家组和质控工作组，负责全省农业源普查技术指导和质量控制工作。其中专家组负责全省农业污染源普查指导工作，研究解决入户调查和原位监测过程中的技术问题；质控工作组分为8个小组，负责不同的市、县（区）农业污染源普查质控培训、指导和审核工作。